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<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">Hi Robin,<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">*** Firstly, if you have moved from Apache 2.2 to Apache 2.4, make sure your restricted documents are restricted!<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">*** There may be a change needed in ~/archives/ARCHIVEID/cfg/cfg.d/security.pl<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">*** See: https://github.com/eprints/eprints/issues/322<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D"><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">On to your reported problem&#8230;<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">I would check any 'commit' triggers in your repository config.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">This might also help (it's a bit crude, but has helped me in the past) - grepping for a 'ne' on line 48 of a repository's config:<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">grep -n ' ne ' archives/ARCHVIEID/cfg/ &nbsp;| grep 48<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">if that doesn't return anything, try other config locations&nbsp; like lib/cfg.d/
<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D"><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">I suspect there's a commit trigger that either:<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">- works OK if there's an online session, but not from the command-line<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">- generates a warning that's ignored in an online session, but not in the bin script - which then fails<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D"><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">Does that help at all?<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D"><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">Cheers,<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">John<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D"><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>
<div>
<div style="border:none;border-top:solid #E1E1E1 1.0pt;padding:3.0pt 0cm 0cm 0cm">
<p class="MsoNormal"><b><span lang="EN-US" style="mso-fareast-language:EN-GB">From:</span></b><span lang="EN-US" style="mso-fareast-language:EN-GB"> eprints-tech-bounces@ecs.soton.ac.uk [mailto:eprints-tech-bounces@ecs.soton.ac.uk]
<b>On Behalf Of </b>Robin Sylvestre via Eprints-tech<br>
<b>Sent:</b> 19 November 2019 18:42<br>
<b>To:</b> eprints-tech@ecs.soton.ac.uk<br>
<b>Subject:</b> [EP-tech] Lift_embargos: Can't call method &quot;current_repository&quot; on an undefined value<o:p></o:p></span></p>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="FR-CA">Hello fellow Eprinters,<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="FR-CA"><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA">We&#8217;ve been running Eprints 3.3.13 and a modified &#8220;lift_embargos&#8221; script for quite some time without any issue. But we noticed lately that the script has stopped working. It seems that it is now unable to
<i>commit </i>any changes. Running in debug mode, I can see that the script fails after calling the &#8220;$doc-&gt;commit(1)&#8221; line:
<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA"><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:35.4pt"><span lang="EN-CA" style="font-family:&quot;Courier New&quot;">Lifting expired embargo on eprint #2957, document #41378 (2019-11-19)<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:35.4pt"><span lang="EN-CA" style="font-family:&quot;Courier New&quot;"><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:35.4pt"><span lang="EN-CA" style="font-family:&quot;Courier New&quot;">main::CODE(0x999baa0)(lift_embargos:149):<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:35.4pt"><span lang="EN-CA" style="font-family:&quot;Courier New&quot;">149:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; if( !$dryrun )<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:35.4pt"><span lang="EN-CA" style="font-family:&quot;Courier New&quot;">150:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; {<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:35.4pt"><span lang="EN-CA" style="font-family:&quot;Courier New&quot;">main::CODE(0x999baa0)(lift_embargos:151):<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:35.4pt"><span lang="EN-CA" style="font-family:&quot;Courier New&quot;">151:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; $doc-&gt;set_value( &quot;security&quot;, &quot;public&quot; );<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:35.4pt"><span lang="EN-CA" style="font-family:&quot;Courier New&quot;">main::CODE(0x999baa0)(lift_embargos:152):<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:35.4pt"><span lang="EN-CA" style="font-family:&quot;Courier New&quot;">152:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; $doc-&gt;set_value( &quot;date_embargo&quot;, undef );<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:35.4pt"><span lang="EN-CA" style="font-family:&quot;Courier New&quot;">main::CODE(0x999baa0)(lift_embargos:154):<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:35.4pt"><span lang="EN-CA" style="font-family:&quot;Courier New&quot;">154:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;$doc-&gt;commit( 1 ); # pass force through to parent eprint<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:35.4pt"><span lang="EN-CA" style="font-family:&quot;Courier New&quot;"><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:35.4pt"><span lang="EN-CA" style="font-family:&quot;Courier New&quot;">Use of uninitialized value in string ne at (eval 65)[(eval 55)[/usr/share/eprints/bin/../perl_lib/EPrints/Config.pm:272]:19] line 48.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:35.4pt"><span lang="EN-CA" style="font-family:&quot;Courier New&quot;">at (eval 65)[(eval 55)[/usr/share/eprints/bin/../perl_lib/EPrints/Config.pm:272]:19] line 48.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:35.4pt"><span lang="EN-CA" style="font-family:&quot;Courier New&quot;">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; EPrints::Config::Ecole::__ANON__[(eval 65)[(eval 55)[/usr/share/eprints/bin/../perl_lib/EPrints/Config.pm:272]:19]:68]('EPrints::DataObj::Document=HASH(0x9a2f8f0)')
 called at /usr/share/eprints/bin/../perl_lib/EPrints/Repository.pm line 1726<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:35.4pt"><span lang="EN-CA" style="font-family:&quot;Courier New&quot;">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; eval {...} called at /usr/share/eprints/bin/../perl_lib/EPrints/Repository.pm line 1726<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:35.4pt"><span lang="EN-CA" style="font-family:&quot;Courier New&quot;">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; EPrints::Repository::call('EPrints::Repository=HASH(0x4654aa0)', 'set_document_automatic_fields', 'EPrints::DataObj::Document=HASH(0x9a2f8f0)') called
 at /usr/share/eprints/bin/../perl_lib/EPrints/DataObj.pm line 463<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:35.4pt"><span lang="EN-CA" style="font-family:&quot;Courier New&quot;">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; EPrints::DataObj::update_triggers('EPrints::DataObj::Document=HASH(0x9a2f8f0)') called at /usr/share/eprints/bin/../perl_lib/EPrints/DataObj/Document.pm
 line 1217<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:35.4pt"><span lang="EN-CA" style="font-family:&quot;Courier New&quot;">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; EPrints::DataObj::Document::commit('EPrints::DataObj::Document=HASH(0x9a2f8f0)', 1) called at lift_embargos line 154<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:35.4pt"><span lang="EN-CA" style="font-family:&quot;Courier New&quot;">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; main::__ANON__[lift_embargos:184]('EPrints::Repository=HASH(0x4654aa0)', 'EPrints::DataSet=HASH(0x57200e8)', 'EPrints::DataObj::Document=HASH(0x9a2f8f0)',
 undef) called at /usr/share/eprints/bin/../perl_lib/EPrints/List.pm line 664<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:35.4pt"><span lang="EN-CA" style="font-family:&quot;Courier New&quot;">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; EPrints::List::map('EPrints::List=HASH(0x2ff0af8)', 'CODE(0x999baa0)') called at lift_embargos line 184<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:35.4pt"><span lang="EN-CA" style="font-family:&quot;Courier New&quot;;background:yellow;mso-highlight:yellow">Can't call method &quot;current_repository&quot; on an undefined value at /usr/share/eprints/bin/../perl_lib/EPrints/BackCompatibility.pm
 line 443.</span><span lang="EN-CA" style="font-family:&quot;Courier New&quot;"><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA" style="font-family:&quot;Courier New&quot;"><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA">Looking at the code, I can see that the session information is passed to the other functions, but it doesn&#8217;t seem to be working anymore as the session is undefined when calling the method &#8220;current_repository&#8221; on line
 443 of BackCompatibility.pm:<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA"><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin-left:35.4pt"><span lang="EN-CA" style="font-family:&quot;Courier New&quot;">return $EPrints::HANDLE-&gt;current_repository;<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA"><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA">The only thing that changed in the last few weeks has been a server upgrade (not sure what was the previous version but we are now running on CentOS 7 with Perl 5.16.3 and Apache 2.4.6). Using the workflow to commit changes
 still work without any issue. <o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA"><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA">Has anyone encountered this error before? Could this be related to Perl or Apache&#8217;s configuration?
<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA"><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA">Thank you for your input on this issue!<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-CA"><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>
<div>
<p class="MsoNormal"><b><span lang="FR-CA" style="font-size:16.0pt;color:#BF8F00;mso-fareast-language:FR-CA">Robin Sylvestre</span></b><span lang="FR" style="mso-fareast-language:FR-CA"><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><b><span lang="FR-CA" style="mso-fareast-language:FR-CA">Technicien des systèmes informatisés</span></b><span lang="FR" style="mso-fareast-language:FR-CA"><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="FR-CA" style="mso-fareast-language:FR-CA">Bibliothèque Louise-Lalonde-Lamarre</span><span lang="FR" style="mso-fareast-language:FR-CA"><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="FR-CA" style="mso-fareast-language:FR-CA">Polytechnique Montréal</span><span lang="FR" style="mso-fareast-language:FR-CA"><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="FR-CA" style="mso-fareast-language:FR-CA">514-340-4711 poste 5973</span><span lang="FR" style="mso-fareast-language:FR-CA"><o:p></o:p></span></p>
</div>
<p class="MsoNormal"><span lang="FR-CA" style="mso-fareast-language:FR-CA">&nbsp;</span><span lang="FR-CA"><o:p></o:p></span></p>
</div>
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</html>