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<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal">Hi,<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">I&#8217;ve been investigating some slowness issues with our database and discovered that some of the tables don&#8217;t have primary keys &#8211; e.g. eprint__index.<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">On our live system running 3.3.10 (migrated from 3.1.1, and 2.[something] before then), this is the table definition:<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">mysql&gt; SHOW CREATE TABLE eprint__index \G<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">*************************** 1. row ***************************<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Table: eprint__index<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Create Table: CREATE TABLE `eprint__index` (<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">&nbsp; `fieldword` varchar(255) DEFAULT NULL,<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">&nbsp; `pos` int(11) DEFAULT NULL,<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">&nbsp; `ids` text,<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">&nbsp; KEY `pos` (`pos`),<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">&nbsp; KEY `fieldword` (`fieldword`,`pos`)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=latin1<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
<p class="MsoNormal">There are two keys, but no primary key.<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
<p class="MsoNormal">On a dev install of EPrints 3.3.12, this is the table definition:<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">mysql&gt; SHOW CREATE TABLE eprint__index \G<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">*************************** 1. row ***************************<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Table: eprint__index<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Create Table: CREATE TABLE `eprint__index` (<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">&nbsp; `fieldword` varchar(128) CHARACTER SET utf8 COLLATE utf8_bin NOT NULL,<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">&nbsp; `pos` int(11) NOT NULL,<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">&nbsp; `ids` longtext CHARACTER SET utf8 COLLATE utf8_bin NOT NULL,<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">&nbsp; PRIMARY KEY (`fieldword`,`pos`)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">) ENGINE=InnoDB DEFAULT CHARSET=utf8<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
<p class="MsoNormal">A primary key exists.<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">There are differences in the version of MySQL, but it looks like there&#8217;s a possibility that during an upgrade either the __index tables were missed out of some update, or excluded for some reason.<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">There is also the difference in character set &#8211; which should be caught by ~/bin/epadmin:upgrade_3_1_2_to_3_2_0<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
<p class="MsoNormal">Inspecting the code, this block: <a href="https://github.com/eprints/eprints/blob/3.3/perl_lib/EPrints/Database.pm#L599-L605">
https://github.com/eprints/eprints/blob/3.3/perl_lib/EPrints/Database.pm#L599-L605</a> will not add the primary key to existing tables.<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
<p class="MsoNormal">Can anyone shed any light on this?<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Do your __index tables have a primary key?<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
<p class="MsoNormal">Cheers,<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">John<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
</div>
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